يهدف القسم إلى تخريج تقنيين للعمل في المختبرات الطبية في مؤسسات الدولة والقطاع الخاص وإمكانية الاستفادة منهم في مراكز البحث العلمي ليكونوا مسؤولين عن مختلف التحضيرات المختبرية التي يحتاجها الباحثون في تلك المراكز , وكما يمكن الاستفادة من خريجي هذا القسم في مختبرات الكليات والمعاهد ذات العلاقة باختصاصهم , حيث يستطيع خريجو القسم أنجاز الأعمال التقنية في مجالات  علم الجراثيم وعلم المصول وعلم الكيمياء السريرية وعلم الطفيليات وعلم الفطريات وعلم الفيروسات وعلم الامراض النسيجية و الخلوية  وعلم امراض الدم وعلم نقل الدم وفي علم الأحياءالجزيئي باستخدام التقنيات الحديثة .